员工不在公司缴纳社保，不仅违法，还会给双方带来多重法律风险，具体如下：
1. 行政处罚风险：公司未为员工缴纳社保，社保行政部门可责令限期改正；逾期不改的，处应缴社保费1-3倍罚款。例如，某公司10名员工月均社保应缴5万元，逾期未改将面临5万-15万元罚款。
2. 员工待遇缺失风险：因公司未缴社保，员工可能无法报销医疗费、领取养老金等。例如，员工王某因公司未缴医保，住院自费5万元，造成重大经济损失。
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员工不在公司缴纳社保的违法性认定，存在特殊情况需具体分析：
1. 劳务关系情形：如兼职人员、退休返聘人员等，双方属劳务关系，公司无需缴纳社保，此时不违法，需优先确认用工性质。
2. 员工自愿挂靠社保：部分员工因户籍等原因自行在第三方单位缴纳社保，但与现公司存在劳动关系的，现公司仍需缴纳，不可免责。
3. 协商缓缴情形：公司因不可抗力或经营严重困难，经社保部门批准后可暂缓缴纳，期间不视为违法，但需按程序办理手续。
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员工不在公司缴纳社保是否违法，需结合具体情形判断：
- 劳动关系且法定参保范围：用人单位与员工存在劳动关系，且员工属法定参保范围的，公司不为其缴纳社保违法。

1. 未办理社保登记：自用工之日起30日内未办理登记，违反《社会保险法》第五十八条，需补缴社保费并承担行政处罚责任。

2. 已登记但欠缴少缴：已登记但欠缴、少缴社保费的，违反《社会保险法》第八十六条，将面临滞纳金及罚款。

3. 非劳动关系情形：如劳务关系等，双方无劳动法意义用工关系的，公司无需缴纳社保，此时不违法。
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处理员工社保问题时，双方常因法律认知不足陷入误区：
1. 自愿放弃协议无效：员工与公司签订自愿放弃社保协议，因违反法律强制性规定无效，公司仍需缴纳。
2. 现金补贴不可替代：以“社保补贴”形式替代缴纳社保，无法免除公司责任，员工可要求补缴，公司还需支付滞纳金和罚款。
3. 维权时效限制：主张补缴社保的时效一般为知道或应当知道权利被侵害之日起1年内，超期可能维权困难。
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